В панели ISPManager в меню "Инструменты" нажмите на "Менеджер процессов"

Выведется список всех активных процессов:

Для управления ими используйте кнопки справа-вверху:

Первая кнопка - обновить список, вторая - отправить процессу сигнал HUP(перезапустить), третья - отправить процессу сигнал TERM(корректно остановить процесс), четвертая - отправить процессу сигнал KILL(жестко убить процесс). При двойном клике на процесс ему также отправится сигнал KILL.
Рекомендуем для завершения процессов использовать TERM, а не KILL, и использовать KILL только в крайних случаях(если процесс завис и не реагирует на TERM).